Skjærgården på Hvaler og i Fredrikstad danner store sammenhengende områder med rikt artsmangfold både på land og under vann. Det meste av nasjonalparken er hav- og sjøbunn. Med bløtbunn, rike tareskoger og koraller innehar nasjonalparken et komplett økosystem under vann.
På land møtes du av landskap som går fra blankskurte svaberg til vindpåvirket kystskog. Dette er også attraktive områder for kystnært friluftsliv.
I Ytre Hvaler nasjonalpark er det mange muligheter for et aktivt friluftsliv og opplevelse av et variert plante- og dyreliv.
Nasjonalparksenteret ligger på Skjærhalden, ytterst i Hvalers skjærgård. Senteret ligger øverst i det gamle Kornmagasinet, med flott utsikt over Europas første marine nasjonalpark.
