Nasjonalparken ligger på en halvøy i Båtsfjord, Nesseby, Vadsø og Vardø kommuner, øst i Finnmark fylke.
Nasjonalparken er godt egnet for turer både med ski, til fots og sykkel. Terrenget, særlig sør for Skipskjølen, er lettgått over store områder.
Plantelivet er særpreget som følge av at Varangerhalvøya er et møtested for arter fra det nordlige Arktis, det østlige Sibir og mer sørlige planter. Varangerhalvøya er fra naturens side et ideelt sommerbeiteland for rein.
Varangerhalvøya er Norges største halvøy. Landskapet er svært gammelt i Skandinavisk målestokk, og i stor grad formet før istidene.