Loven pålegger kommunene et generelt ansvar for å ta hensyn til fiskeressursene. Myndighet til å behandle fysiske tiltak som kan påvirke fisk og fiskeressurser er i hovedsak lagt til statlig forvaltningsmyndighet ved fylkesmannen.
Kommunene må vurdere om tiltak og planer som behandles etter Pbl også må behandles etter lov om laksefisk og innlandsfisk. På samme vis vil en del tiltak som forutsetter tillatelse etter denne loven også måtte behandles i medhold av Pbl.