En helhetlig forvaltningsplan for Nordsjøen-Skagerrak er under utarbeidelse. Planen skal bygge videre på forvaltningsplanen for Barentshavet og Norskehavet. Direktoratet for naturforvaltning deltar i faggruppen, som innen 2013 skal ferdigstille forvaltningsplanen.
Klima- og forurensningsdirektoratet leder faggruppen som skal utarbeide et felles faglig grunnlag for en forvaltningsplan for Nordsjøen-Skagerrak. Arbeidet skal pågå i perioden 2010-2012, og utredningene skal gjelde i perioden fram til 2030.
Den geografiske avgrensningen for arbeidet med det faglige grunnlaget er satt til området utenfor grunnlinja i norsk økonomisk sone sør for stad 62o N, inkludert norsk del av Skagerrak samt områder innenfor grunnlinja og utenfor norsk økonomisk sone der dette er relevant for å beskrive forhold i forvaltningsplanområdet.