Direktoratet for naturforvaltning oppnevnte i 2008 en arbeidsgruppe som skulle lage et problemnotat om sjøaure. Bakgrunnen var den negative utvikling av sjøørretfangstene i store deler av landet de senere årene. Notatet inneholder både problembeskrivelser og anbefalinger til forvaltningen.
Sjøørretfangstene er nær halvert på Vestlandet og i Midt-Norge de siste 5 årene. Det er sterke indikasjoner på at bestandsutviklingen de senere årene skyldes redusert sjøoverlevelse. Hovedårsakene synes å være utslipp av lakselus fra oppdrettsanlegg sammen med dårligere næringstilgang og klimaendringer. Arbeidsgruppen tilrår at sjøørretfisket reduseres og at det iverksettes ytterligere tiltak for å redusere lakselusproblemet i oppdrettsnæringen. I tillegg tilrådes økt forskning og overvåkning for å finne ut mer om problemet.