Trondheim er det nasjonale kompetansesenter innen forskning og forvatning av biologisk mangfold. Handlingsprogrammet for naturmiljøet i Trondheim ble enstemming vedtatt i bystyret 1. august 2006. Kommunen signerte Countdown 2010-erklæringa under åpninga av Trondheimskonferansen 29. oktober 2007.
Trondheim kommune har som miljømål at bynære bekker skal ha god økologisk tilstand. I forbindelse med et større veiprosjekt ble Ilabekken åpnet. Tiltak for å redusere forurensningsutslipp fra kommunale avløp og biotoptiltak for å sikre levedyktive sjøørretbestander er nå igangsatt.
Trondheim er en viltrik kommune, men leveområdene for mange arter trues på grunn av fragmentering av leveområder. Storfulgbestandene nærmer seg nå en kritisk grense. I 2008 vil Trondheim kommune i samarbeid med ornitologer fra NTNU, Vitenskapsmuseet konsenterer innsatsen mot å få oversikt over leikforekomster av storfugl i Bymarka. Storfugl blir brukt som indikatorart for en ønsket skogtilstand i Bymarka. Leikregistreringer ble gjort i april/mai og i til høsten skal det undersøkes hvilke skogelementer som benyttes av storfugl på denne årstiden. I løpet av våren 2008 vil det foreligge en ny skogtakst for alle skogarealene i Trondheim kommune. Denne taksten blir et grunnlag for å sannsynliggjøre hvilke skogbestander som er mest biologisk verdifulle.
Systematisk skjøtsel for å sikre området som historisk kulturlandskap har pågått siden 2005. Rydding av gjengrodde arealer, regelmessig slått skal sikre og restaurere biologisk mangfold. Botanisk overvåkning blir årlig fulgt opp for å sikre at skjøtselen er i tråd med intensjonene. Lian-Solem ble ryddet i vikingetiden og siden har området blitt brukt til dyrking og beiting. Et stort antall karplanter finnes her, 149 arter. Trondheim kommune har i samarbeid med NTNU (Vitenskapsmuseet) og beboerforeningen på Lian lagt planer for botanisk registrering og skjøtselstiltak i 2008.
En botanisk vurdering vil bli gjort så snart forholdene tillater det (i slutten av mai). Ulike skøtseltiltak vil deretter vurderes. For deler av kulturlandskapet ser vi allerede nå akutt behov for tiltak. Det jobbes derfor med en løsning for å gjerde inn store deler av området. Innenfor flere felter vil vi benytte beitedyr som tiltak. Beboerforeningen vil organisere beitedyrene. Botanikerne vil utover sommeren foreta flere registreringer, og realistiske skjøtseltiltak vil etter hvert komme på plass. Prosjektet bærer preg av at veien blir til mens vi går. Det finnes liten kunnskap om kobling bevaring av biologisk mangfold -skjøtsel i slike kulturlandskap i lavlandet
